Nowy punkt odniesienia w ekstrakcji DNA z wody środowiskowej — sekwencjonowanie Bigefei przyspiesza badania naukowe

Zestaw opiera się na zoptymalizowanym systemie buforowym połączonym z wysokowydajnymi nanokulkami magnetycznymi. Genomowe DNA specyficznie wiąże się z grupami funkcyjnymi na powierzchni kulek i jest rozdzielane pod wpływem zewnętrznego pola magnetycznego. Po wielokrotnym delikatnym płukaniu w celu usunięcia białek, soli i innych zanieczyszczeń, ostatecznie wymywa się genomowe DNA o wysokiej czystości.

Zestaw, specjalnie zaprojektowany do próbek wody środowiskowej, skutecznie ekstrahuje DNA bakterii zebrane na membranach filtracyjnych, w tym bakterii Gram-ujemnych i Gram-dodatnich (do 2 × 10⁹ komórek bakteryjnych na jedną membranę filtracyjną). Jest kompatybilny z w pełni zautomatyzowanymi systemami ekstrakcji kwasów nukleinowych do przetwarzania o wysokiej przepustowości. Wyekstrahowane DNA charakteryzuje się stałą jakością i może być bezpośrednio wykorzystywane do PCR/qPCR, NGS i innych zastosowań.

Cechy produktu

1. Szerokie spektrum możliwości ekstrakcji bakterii

Skutecznie ekstrahuje bakterie Gram-ujemne i Gram-dodatnie z próbek wody, obejmując zbiorowiska mikroorganizmów powszechnie występujące w środowisku słodkowodnym i morskim oraz spełniając zróżnicowane wymagania analityczne.

2. Wysoka czystość i wysoka wydajność

Dostarcza DNA o wysokiej czystości, wolne od zanieczyszczeń hamujących i o stabilnej wydajności, odpowiedniej do bezpośrednich dalszych zastosowań molekularnych.

3. Zautomatyzowana i wysoce wydajna kompatybilność

Pełna kompatybilność z systemami automatycznej ekstrakcji kwasów nukleinowych Bigfish, obsługa jednoczesnego przetwarzania 32 lub 96 próbek, co znacznie skraca czas przetwarzania i zwiększa wydajność laboratorium.

4. Bezpieczna i przyjazna dla użytkownika obsługa

Brak konieczności stosowania toksycznych odczynników organicznych, takich jak fenol czy chloroform, minimalizuje ryzyko związane z bezpieczeństwem w laboratorium. Podstawowe odczynniki są wstępnie pakowane w płytki 96-dołkowe, co zmniejsza liczbę błędów związanych z ręcznym pipetowaniem i upraszcza przepływ pracy.

Kompatybilne instrumenty

Duża ryba BFEX-16E

BFEX-32

BFEX-32E

BFEX-96E

Wyniki eksperymentalne

Próbkę wody rzecznej o objętości 600 ml przefiltrowano przez membranę, a DNA wyekstrahowano za pomocą zestawu Bigfish do ekstrakcji i oczyszczania genomowego DNA z wody środowiskowej na bazie kulek magnetycznych wraz z kompatybilnym urządzeniem. Wyekstrahowane DNA następnie przeanalizowano metodą elektroforezy w żelu agarozowym.